Il PUP opera all'interno del ufficio UniGe per l'Apprendimento permanente e ha una sede operativa in piazza della Nunziata 9 a Genova.

Dal 2021 le sedi operative sono le principali case circondariali della regione Liguria: La Spezia, Genova Marassi, Genova Pontedecimo, Sanremo.

Dal 2024 si è aggiunta la casa circondariale di Chiavari.